1661年，「安平開臺天后宮」鎮殿媽祖隨國姓爺收復台灣。據廟史記載，鎮殿媽祖係國姓爺拜請鎮舟之船頭媽。
兵馬倥傯之初供奉媽祖於「王城」熱蘭遮城(Fort Zeelandia)教堂內。1668年，延平嗣王鄭經建廟，稱「天妃宮」。
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據「安平開臺天后宮」廟史記載，1668年延平嗣王鄭經建廟，稱「天妃宮」。
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安平天后宮於大殿祭祀開臺聖王延平王國姓爺 鄭成功與三太子中壇元帥，原址係位於現在的石門國小，現開臺天后宮位址原為前清台灣水師協副將衙門。
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| 安平天后宮於大殿祭祀開臺聖王延平王國姓爺 鄭成功與三太子中壇元帥。 |
1895年，乙未抗日臺灣民主國最後一戰，抗日軍不幸在舊天后宮(天妃宮)處遭日軍殺害，殿堂罹兵燹之災，故遭拆除。
石門國小現址原為安平鎮渡口，舊天后宮拆除後，日本政府於原址建安平公學校。
清安平水師副將衙門位於現「安平古堡」(Fort Zeelandia)廣場前，日軍據台後，水師衙門遭拆除，二戰後國府來台。
1962年，信眾於水師副將衙門舊址重建天后宮。
先祖 鄭超英與安平天后宮淵源深厚…
1890年(光緒十六年)，先祖任安平水師協副將，據廈門學者考證係國姓爺後人，而水師協與安平天后宮更是關係密切，每年三月迎媽祖慶典水師協衙門出錢出力、著力甚深。
(安平的廟宇與儀式傳統,成大社科中心客座研究員、廈門大學歷史系教授,鄭振滿)
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| 例年安平迎媽祖，各地的媽祖宮會前來聚會，安平媽祖宮標榜為開台媽祖宮。 |
1895年(光緒二十一年)，臺灣民主國宣佈獨立，乙未戰爭爆發，先祖率三營水師舊部鎮守安平，但總兵劉永福卻阿婆仔浪港，臨陣遁逃，民主國守軍群龍無首。
當台南府城被日軍三面包抄之際，在舊安平開臺天后宮前，原址位於現石門國小、昔日安平鎮之渡口 ，民主國守軍遭遇拂曉突擊的日軍精銳海陸先遣部隊，
據先父口述，先祖 鄭超英代理總兵乙職，壯烈殉國…
因政權更替，後人為避禍隱姓埋名，吳宮花草埋幽徑、歷史埋沒於荒煙漫草間。
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1895年，臺灣民主國最後一戰，抗日軍在舊天后宮(天妃宮)處遭日軍殺害，殿堂遭拆除。
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盼先祖為台灣民主國抗日犧牲之史蹟得以重現天日，
願乙未國殤在天之靈得以安息，
上天保祐……
